DQS Cemani mepunyai Program Intensif Tahfidzul Quran untuk tingkat SMP dan Pasca SLTA dengan target bacaan fasih sesuai kaidah tajwid, tartil, hafal 30 Juz dengan metode Fami Bisyauqin, dalam peningkatan kuantitas dan kualitas bacaan serta hafalan Al Quran.

DQS Cemani mengadakan Daurah atau Tahfidz Camp yang di laksanakan setiap awal semester, kemudian setelah di kualifikasi santri di bagi menjadi dua kelas, yang pertama I’dad yaitu kelas yg di tempuh selama 6 bulan untuk mempelajari:
1. Metode baca Quran kaidah Daqu dan Ummi
2. Khatam binnadzor 3. Surat pilihan( kahfi, sajadah, yasin, dukhon, tabrok, serta 2 juz. )
4. Literasi Al Quran atau Imla’. Semu pencapaian akan di ujikan di akhir semester dan di berikan sertifikat.

Bagi santri yg sudah memenuhi kualifikasi bacaan dan hafalan istimewa, bisa langsung mengikuti program yg kedua yaitu Pendidikan Khusus (PK) , Program ini santri di tuntut disiplin dan istiqomah melaksanakan 2 kali setoran Ziyadah, 2 kali Murojaah, dan 5 juz Baca Bersama setiap Hari, maka setiap bulan santri wajib menambah hafalan minimal 1 juz sekaligus di juziyahkan, setiap 4 bulan khomsiah, dan setiap tahun 15 juz. dengan sistem seperti ini, di harapkan santri dapat menyeselesaikan hafalannya 30 Juz dalam waktu 2 tahun, sembari 6 bulan berikutnya mempersiapkan tas’mik kubro (30 Juz sekali duduk/ gelondongan.

Adapun Sanad Tahfidz di berikan Kepada santri yang mengikuti Tasmi’Kubro. Bagi santri yg sudah mempunyai hafalan bisa mengikuti tabarrukan minimal mengikuti setoran hafalan selama satu tahun, sedangkan syahadah tahfidz di berikan kepada santri yg lulus Ujian kelipatan 10 Juz.

Bagi muhafidzah yg ingin mengajar Al Quran harus lulus tes baca Quran tingkat Wustho dan mengikuti sertifikasi metode Ummi. Santri yang sudah menyelasikan Hafalan dan masih di aktif Ponpes akan training berdakwah dengan mengisi kajian tafsir, simaan, mengajar Al Quran di masyarakat sekitar Ponpes, dan dapat melaksakan Riyadhoh Al Quran.